init depot renew

2026-09-22 11:58:57 +02:00
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@@ -0,0 +1,103 @@
+from pycen import con_gn
+import geopandas as gpd
+import requests
+
+def get_list_observateur(code_liste,with_data=False):
+    """
+    @code_liste : str. Nom du sous-module monitoring où chercher les sites.
+    @with_data : bool.
+    """
+
+    if with_data is True:
+        sql = '''
+            SELECT * FROM utilisateurs.t_listes 
+            JOIN (utilisateurs.cor_role_liste JOIN utilisateurs.t_roles t USING (id_role)) USING(id_liste)
+        '''
+    elif with_data is False:
+        sql = '''
+            SELECT code_liste list_name,id_role,nom_role||' '||prenom_role nom_complet FROM utilisateurs.t_listes 
+            JOIN (utilisateurs.cor_role_liste JOIN utilisateurs.t_roles t USING (id_role)) USING(id_liste)
+        '''
+    else : 
+        raise('Argument `with_data` dont accept value "%s"'%with_data)
+
+    wh = " WHERE (id_liste = {mod} OR code_liste = '{mod}')".format(mod=code_liste)
+
+    SQL = sql + wh
+    return  gpd.pd.read_sql_query(sql=SQL,con=con_gn)
+
+
+
+def get_site(module,id_site=None,with_data=False):
+    """
+    @module : str. Nom du sous-module monitoring où chercher les sites.
+    @id_site : str. Nom du site au sein du sous-monitoring où chercher les sites.
+    @with_data : bool.
+    """
+
+    if with_data is True:
+        sql = '''
+            SELECT * FROM gn_monitoring.t_base_sites 
+            JOIN (gn_monitoring.cor_site_module JOIN gn_commons.t_modules t USING (id_module)) USING (id_base_site)
+        '''
+    elif with_data is False:
+        sql = '''
+            SELECT id_base_site,base_site_name,
+            (ST_Y(geom)::numeric)::text||' '||(ST_X(geom)::numeric)::text geometry
+            FROM gn_monitoring.t_base_sites 
+            JOIN (gn_monitoring.cor_site_module JOIN gn_commons.t_modules t USING (id_module)) USING (id_base_site)
+        '''
+    else : 
+        raise('Argument `with_data` dont accept value "%s"'%with_data)
+
+    wh = " WHERE (t.module_code = '{mod}' OR t.module_label = '{mod}')".format(mod=module)
+
+    if id_site is not None:
+        wh = wh + " AND id_site = '%s'"%id_site
+
+    SQL = sql + wh
+    return  gpd.pd.read_sql_query(sql=SQL,con=con_gn)
+    # return  gpd.read_postgis(sql=SQL,con=con_gn,geom_col='geometry')
+
+
+def get_jdd(module):
+    url = 'https://geonature.cen-isere.fr/geonature/api/monitorings/util/init_data/{mod}'
+    r = requests.get(url.format(mod=module), auth=('user', 'pass'))
+    if r.status_code == 200:
+        d = r.json()
+        return gpd.pd.DataFrame(d['dataset'])[['id_dataset','dataset_name']]
+
+
+def get_taxon(id_list=100,args={}):
+    url = 'https://geonature.cen-isere.fr/taxhub/api/taxref/allnamebylist/{list}?limit=100000&offset=0'
+    if args is not None:
+        formArgs = '&'.join(['='.join([x,args[x]]) for x in args])
+        url = 'https://geonature.cen-isere.fr/taxhub/api/taxref/?'+formArgs
+    r = requests.get(url.format(list=id_list), auth=('user', 'pass'))
+    if r.status_code == 200:
+        d = r.json()
+        if args is not None:
+            d = r.json()['items']
+        df = gpd.pd.DataFrame(d)
+        return df[['cd_nom','lb_nom','nom_vern']].rename(columns={'lb_nom':'nom_complet'})
+
+
+if __name__ == "__main__":
+
+    module_name = "chiro"
+    id_tax_list = 100      # taxons occtax 
+
+    PATH = '/media/cgeier/SRV/homer_geonat/home/geonatureadmin/protocoles_suivi/{mod}/odk_form/'.format(mod=module_name)
+    PATH = '/home/colas/Documents/9_PROJETS/6_GEONATURE/MODULES/ODK/test/CHIRO/'
+    csv_site_name = 'gn_sites.csv'
+    csv_jdd_name = 'gn_jdds.csv'
+    csv_tax_name = 'gn_taxons.csv'
+    get_site(module_name).to_csv(PATH+csv_site_name,sep=';',index=False)
+    get_jdd(module_name).to_csv(PATH+csv_jdd_name,sep=';',index=False)
+    get_taxon(args={'ordre':'Chiroptera'}).to_csv(PATH+csv_tax_name,sep=';',index=False)
+
+    code_liste = '2'
+    csv_obs_name = 'gn_observateurs.csv'
+    get_list_observateur(code_liste).to_csv(PATH+csv_obs_name,sep=';',index=False)
+
+