init depot renew

5_GEONATURE/crsp_taxref_old.py

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+
+import pandas as pd
+import geopandas as gpd
+
+from pycen import con_gn
+
+path = '/home/colas/Documents/5_BDD/TAXON/TAXREF/TAXREF_V14_2020/'
+cdnom_disparu = pd.read_excel(path+'CDNOM_DISPARUS.xls')
+cdnom_disparu.columns = cdnom_disparu.columns.str.lower()
+
+def get_bib_list(name):
+    sql = """SELECT bn.* 
+        FROM taxonomie.bib_noms bn
+            JOIN taxonomie.cor_nom_liste c USING (id_nom) 
+            JOIN taxonomie.bib_listes bl USING (id_liste)
+        WHERE lower(bl.nom_liste) = '%s';
+    """%name.lower()
+    return pd.read_sql_query(sql,con_gn)
+
+amp = get_bib_list('Amphibiens')
+amp[amp.cd_nom.isin(cdnom_disparu.cd_nom_remplacement)]
+odo = get_bib_list('Odonates')
+odo[odo.cd_nom.isin(cdnom_disparu.cd_nom_remplacement)]
+flo = get_bib_list('Flore')
+flo[flo.cd_nom.isin(cdnom_disparu.cd_nom_remplacement)]
+
+cdnom_disparu[cdnom_disparu.cd_nom_remplacement.isin(amp.cd_nom)]
+cdnom_disparu[cdnom_disparu.cd_nom_remplacement.isin(flo.cd_nom)]
+