from pycen import con_gn,con_sicen, update_to_sql
import pandas as pd


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####### Araignée sp. #######
######## Fungi sp. #########
############################
dict_tax = {
    'Pachygnatha sp':195648,
    'Clubiona sp':190950,
    'Enoplognatha sp':192179,
    'Tetragnatha sp':198316,
    'Linyphiidae sp':184366,
    'Episinus sp':192245,
    'Evarcha sp':192480,
    'Thanatus sp':198365,
    'Xysticus sp':199101,
    'Araneidae sp':184354,
    'Pardosa cf saltans':457342, # doute
    'Zora sp':199158,
    'Piratula sp':806893,
    'Pardosa sp':195830,
    'Thomisidae sp':184390,
    'Gnaphosidae sp':184362,
    'Araniella sp':189390,
    'Pirata sp':196303,
    'Trochosa sp':198691,
    'Zelotes sp':199129,
    'Agelena sp':188876,
    'Ozyptila sp':202569,
    'Metellina sp':202546,
    'Hyptiotes cf paradoxus':1058, # doute
    'Phrurolithus sp':196174,
    'Tegenaria sp':198254,
    'Singa sp':197676,
    'Heliophanus sp':193148,
    'Zodarion sp':199147,
    'Tmarus sp':198482,
    'Dysdera sp':192003,
    'Liocranidae sp':184367,
    'Micaria sp':194695,
    'Salticidae sp':184381,
    'Agroeca sp':188904,
    'Lycosidae sp':184368,
    'Zora cf spinimana':1753, # doute
    'Marpissa sp':194474,
    'Alopecosa sp':188992,
    # 'Amphinema diadema':,             # Contact fournisseur données : RIVOIRE Bernard
    'Hyphodermella rosae':905273,
    'Cartilosoma rene-hentic':905220,
    # 'Phanerochaete livescens':,       # Appeler CBNA / RIVOIRE Bernard
    # 'Thanatephorus brevisporus':,     # Contact fournisseur données : RIVOIRE Bernard
    'Phlebia acerina':970280 }


sql = """
    select id_obs,remarque_obs FROM saisie.saisie_observation WHERE cd_nom in ('9999077','9999078')
    and remarque_obs not ilike '%%Amphinema diadema%%'
    and remarque_obs not ilike '%%Phanerochaete livescens%%'
    and remarque_obs not ilike '%%Thanatephorus brevisporus%%'
"""
df = pd.read_sql(sql, con_sicen)

df['cd_nom']  = (df['remarque_obs']
    .str.split('|',n=1)
    .str[0]
    .str.replace('Nom taxon saisi :','')
    .str.strip()
    .replace(dict_tax)
)

sql = 'SELECT cd_nom,regne,nom_vern,phylum,famille,classe,ordre,nom_complet,nom_valide FROM taxonomie.taxref WHERE cd_nom IN {}'
tax = pd.read_sql(sql.format(tuple(df['cd_nom'].unique())), con_gn)

df = (df.merge(tax,how='left',on='cd_nom')
    .drop(columns=['remarque_obs'])
    .astype({'cd_nom':str}))

update_to_sql(
    df,
    con_sicen,
    'saisie_observation',
    'saisie','id_obs')


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######## Myotis sp. ########
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dict_tax = {'9999058':195005}
sql = """
    select id_obs,cd_nom FROM saisie.saisie_observation WHERE cd_nom = '9999058'
"""
df = pd.read_sql(sql, con_sicen)
df.replace({'cd_nom':dict_tax},inplace=True)

sql = 'SELECT cd_nom,regne,nom_vern,phylum,famille,classe,ordre,nom_complet,nom_valide FROM taxonomie.taxref WHERE cd_nom = %i'
tax = pd.read_sql(sql%df['cd_nom'].unique()[0], con_gn)

df = (df.merge(tax,how='left',on='cd_nom')
    .astype({'cd_nom':str}))
update_to_sql(
    df,
    con_sicen,
    'saisie_observation',
    'saisie','id_obs')