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# Exctraction de la BDC Statut à partir d'une liste de taxon.
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Le fichier source doit contenir à minima une colone contenant les `cd_nom` ou `cd_ref` concernés par l'extraction à réaliser.
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Dans le cas où il contient d'autres colonnes (date, nombre, observateur, ...), celles-ci seront jointes au sein des feuillets `pivot_table` et `pivot_libel` ; cf.ci-dessous.
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L'export obtenu se compose des trois feuillets suivant :
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- <ins>v_bdc_status :</ins> c'est un export qusi pure de la vue `taxonomie.v_bdc_status`.
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|cd_nom|cd_ref|regne|phylum|classe|ordre|famille|group1_inpn|group2_inpn|group3_inpn|nom_vern|nom_complet|nom_valide|lb_nom|rq_statut|code_statut|cd_type_statut|label_statut|full_citation|doc_url|
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|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|
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- <ins>pivot_table :</ins> Il correspond à l'export de la vue `taxonomie.v_bdc_status` retourner pour avoir les codes status en colonnes et non en ligne en face de chaque espèce (1 ligne = 1 espèce).
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Au sein de ce feuillet, il est possible qu'une espèce pour un statut, possède plusieurs codes statut. Ces codes seront alors écrit entre `[]` (C'est souvent le cas pour les listes LRN concernant les oiseaux). Dans ce cas, référez-vous au feuillet `v_bdc_status` en filtrant sur l'espèce concerné pour en savoir plus. C'est souvent lié au fait que l'espèce possède un statut différent en fonction des conditions d'observations (exemple : Hiverant, Nicheur, ...).
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Les colonnes récupérées sont les suivantes :
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- <ins>AL :</ins> Liste d'alerte départementale
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- <ins>BARC :</ins> Convention de Barcelone
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- <ins>BERN :</ins> Convention de Berne
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- <ins>BONN :</ins> Convention de Bonn
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- <ins>OSPAR :</ins> Convention OSPAR
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- <ins>DH :</ins> Directive Habitat
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- <ins>DO :</ins> Directive Oiseaux
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- <ins>LRE :</ins> Liste rouge européenne
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- <ins>LRM :</ins> Liste rouge mondiale
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- <ins>LRN :</ins> Liste rouge nationale
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- <ins>LRR_AURA :</ins> Liste rouge régionale AURA
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- <ins>LRR_RA :</ins> Liste rouge régionale (ancienne région)
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- <ins>PNA :</ins> Plan national en cours
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- <ins>exPNA :</ins> Plan national terminé
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- <ins>PAPNAT :</ins> Priorité action publique nationale
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- <ins>POM :</ins> Protection COM
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- <ins>PD :</ins> Protection départementale
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- <ins>PN :</ins> Protection nationale
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- <ins>PR :</ins> Protection régionale
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- <ins>REGLII :</ins> Interdiction d'introduction
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- <ins>REGLLUTTE :</ins> Lutte contre certaines espèces
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- <ins>REGL :</ins> Réglementation
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- <ins>REGLSO :</ins> Réglementation sans objet
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- <ins>SCAP NAT :</ins> SCAP nationale
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- <ins>SCAP REG :</ins> SCAP régionale
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- <ins>SENSDEP :</ins> Sensibilité départementale
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- <ins>SENSNAT :</ins> Sensibilité nationale
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- <ins>SENSREG :</ins> Sensibilité régionale
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- <ins>ZDET :</ins> ZNIEFF Déterminantes
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**ATTENTION :** Il est normal de ne pas retrouver tous les statuts cités à chaque export car les types de statuts non concernées par la liste d'espèce soumises ne figureront pas dans le tableau.
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- <ins>pivot_libel :</ins> Identique à `pivot_table` mais contenant les intitulés des statuts à la place des codes.
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- <ins>dic_type_statut :</ins> Dictionnaire des types de status concerné par l'extraction.
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## Configuration du fichier
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Les variables à modifier se situe de l.215 à l.225 :
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- <ins>l.215 :</ins> Import/Définition de la connexion à la bdd GéoNature. En cas de définition de la connexion, ajoutez/completez le code ci-dessous :
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``` py
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from sqlalchemy import create_engine
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from sqlalchemy.engine import URL
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gn_user = 'XXXX'
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gn_pwd = 'XXXX'
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gn_adr = 'XXXX'
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gn_base = 'XXXX'
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gn_url = URL.create("postgresql+psycopg2", username=gn_user, password=gn_pwd, host=gn_adr, database=gn_base)
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con_gn = create_engine(gn_url)
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```
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- <ins>l.219 :</ins> Variable de configuration de lecture du fichier Excel contenant l'ensemble des taxons.
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- <ins>l.225 :</ins> Intitulé de la colonne listant les codes taxonomiques. |